Michael Gundale undersöker hur samspelet mellan växter och mark påverkar en rad egenskaper hos skogsekosystem, såsom produktivitet, kolinbindning och biologisk mångfald. Han kombinerar flera vetenskapliga discipliner i sin forskning, inklusive växtsamhällens ekologi, biogeokemi och mikrobiell ekologi. Han utnyttjar grundläggande kunskap om samspelet mellan växter och mark för att förstå hur skogars egenskaper kommer att påverkas av regionala och globala förändringar när det gäller sådant som klimat och främmande arter. Ett annat mål är att ta fram ny kunskap om skogens funktion, för en skogsskötsel som gynnar de ekosystemtjänster som samhället värdesätter.